上清丸系列中成药的主要成分大体相同，都含有黄芩、栀子、白芷、防风、荆芥等清热、祛风、止痛的药物。另外，“黄连上清丸”、“牛黄上清丸”、“芎菊上清丸”等所选用的连翘、菊花、桔梗、薄荷、荆芥穗等中草药都是药性柔和、质地较轻，作用于上焦(肺脏、上呼吸道)，具有清热解表的作用，适合治疗由上呼吸道感染所致的发热、疼痛等病症。由于上清丸系列中成药的性味都偏寒，可影响消化功能，所以年老体弱、消化功能不好的病人慎用，孕妇忌用。病人在服药期间应禁用辛辣刺激食物。

　　“上清丸”、“黄连上清丸”、“牛黄上清丸”、“芎菊上清丸”这4种药的功效虽大致相同，但却各有所长。

　　发热、疼痛症状较轻，伴有大便秘结、小便赤黄的普通感冒病人适合选择上清丸治疗。黄连上清丸比上清丸增加了黄连、石膏、蔓荆子、旋覆花等成分。黄连、石膏有较强的清热作用;蔓荆子有疏风、散热、止痛的作用;旋覆花有消痰降气的作用。所以黄连上清丸适合治疗疼痛较重、咳嗽痰多的中重度感冒。牛黄上清丸比黄连上清丸又增加了牛黄和冰片两味药。牛黄是药物中的寒凉极品，冰片有开窍醒神的作用，所以牛黄上清丸适合治疗高热伴有昏昏沉沉甚至神志不清的重度感冒。芎菊上清丸由“川芎茶调散”加味而成，它的成分比上清丸少了有通便作用的大黄，有清下焦热作用的黄柏，增加了有祛风止痛作用的羌活和藁本。所以芎菊上清丸是专治上焦诸症的良药，除了可治疗感冒头痛、咽喉疼痛之外，也可治疗三叉神经痛、偏头痛、舌咽神经痛、丛集性头痛、癫痫性头痛等病症。芎菊上清丸虽然也有清热的作用，但效果不及前三种“上清丸”。因此，伴有高热、大便秘结、小便赤黄的感冒病人，最好不要选用此药。