六味地黄丸不适于和感冒类的中西药同时服用，同时六味地黄丸中含有机酸，不宜与以下几种西药合用：碳酸氢钠、氢氧化铝、碳酸钙、氨茶碱、红霉素、磺胺类药物、利福平、阿司匹林等。如果六味地黄丸需要和其他的西药同时服用，可以间隔开一个小时以上，避免两者发生反应。 肝功能不正常者也可以服用六味地黄丸，因为六味地黄丸不影响肝功能，而且中医认为“肝肾同源”，补肾可以起到保肝的功效。有试验证明六味地黄丸对肝损伤有一定的保护作用，在临床上还有六味地黄丸治疗肝源性糖尿病的记录。